水處理設(shè)備的消毒大體上可分為物理消毒和化學(xué)消毒兩種。紫外線消毒可能只會(huì)對(duì)局部有作用，除菌過(guò)濾器可能只發(fā)回暫時(shí)的作用。在水處理設(shè)備中，不論是巴氏消毒、過(guò)熱水滅菌或純蒸汽滅菌，都被認(rèn)為是較為常規(guī)的物理消毒。臭氧、過(guò)氧化氫、次氯酸等均是常用的化學(xué)消毒劑。

巴氏消毒法。在水處理設(shè)備中，巴氏消毒主要功能是：a,用于水處理設(shè)備的活性炭等預(yù)處理單元。b,RO/EDI單元以及儲(chǔ)存與分配管網(wǎng)單元的周期性消毒。巴氏消毒法也稱低溫消毒法，它的一種能殺死各種病原菌的熱處理方法，其對(duì)象主要是病原微生物及其他生長(zhǎng)態(tài)菌。

水處理設(shè)備常用的物理消毒方式可以達(dá)到的效果??巴氏消毒的工作原理是，利用病原體不是很耐熱的特點(diǎn)，用適當(dāng)?shù)臏囟群捅貢r(shí)間處理，將其全部殺滅。但是經(jīng)過(guò)巴氏消毒后，仍保存小部分較耐熱的細(xì)菌或細(xì)菌芽孢。因此巴氏消毒不是無(wú)菌處理過(guò)程。

紫外線消毒法。在水處理設(shè)備中，紫外線消毒裝置主要安裝于水處理設(shè)備的RO/EDI循環(huán)管路及儲(chǔ)存與分配管網(wǎng)循環(huán)管路，以防止系統(tǒng)中微生物指標(biāo)的過(guò)快增長(zhǎng)。足夠劑量下，紫外輻射是一種有效的消毒方式。紫外線消毒的原理較為復(fù)雜，一般認(rèn)為它與對(duì)生物體內(nèi)代謝、遺傳、變異等現(xiàn)象起著決定性作用的核酸相關(guān)。